Hola George,
Por lo que describes, tal vez te interese la función de Sincronización Selectiva. Puedes leer más al respecto aquí:
https://www.dropbox.com/es/help/175
Básicamente, puedes seleccionar cualquier carpeta dentro de la carpeta de Dropbox para que guarde solamente en la nube y no se sincronice a tu equipo.
¡Espero que esta información te ayude!