Hola, Javier,
Si no puedes encontrar algún archivo en tu cuenta de Dropbox, consulta los consejos en nuestro Centro de ayuda:
https://www.dropbox.com/help/969
Esta página incluye una gran variedad de situaciones y soluciones.
Si tienes demasiados archivos para restaurar y no puedes hacerlo solo, consulta la sección "¡Ayuda!, Hay demasiados archivos para restaurar".
En referencia a tu última observación, es posible identificar al usuario y el ordenador que modificaron un archivo en el "historial de versiones anteriores" en el sitio web. Para obtener más información, consulta este artículo de ayuda: http://www.dropbox.com/help/11
Espero que esto te ayude.